有人認為米開朗基羅在以一種十分淡漠的情感來對待聖賢們與聖母，其實，這種說法是錯誤的。他將人生中的最後二十年都用在建造聖彼得大教堂的工作上，而且他最後一件作品——因其亡故而未完成的聖彼得的雕像，所以把他視作新教徒，那簡直是在開玩笑。我們不可能忘記他曾多次要到遠處朝聖：1545年，他想去朝拜科姆波斯泰雷的聖雅克，1556年，他又計劃著要去朝拜洛雷泰，而且他還是聖·讓一帕蒂斯坦兄弟會的成員。但是，就像所有偉大的基督徒一樣，他的生死都與基督同在，這是毋庸置疑的。1512年，在他寫給父親的信中，說道：「我與基督一同過著清貧的日子。」就在他臨終前，他還請求人家允許他回憶基督的苦難。自從和維多麗亞·科洛娜成為摯友後，尤其是在科洛娜去世之後，他的這種信仰變得更加強烈。在他將自己的藝術幾乎完全奉獻給基督，並用於頌揚基督的苦難時，他的詩作也被籠罩上了一層神秘主義色彩。他丟棄了藝術，反而躲進了受難的基督張開著的巨臂之中：
「我卑微的生命，漂泊在波濤洶湧的大海上，由一葉殘破的小舟乘載著，渡到了共同的港口。人們紛紛在此登陸，並匯報說明自己所有的虔敬與褻瀆的作品。致使我將藝術看作是偶像，是君王所固有的那份激烈的幻想。今天看來，我發現它是多麼錯誤的啊。而且，我清楚地看到，原來人們追求著的東西終歸是苦難。愛情的思念、虛無的快樂念頭，當我此刻已臨近死亡時，它們又有什麼意義呢？一個令我確信無疑，另一個卻威脅著我。無論繪畫還是雕刻，我都能平復心境，我的心靈已經轉向那份矗立於十字架上，向我們張開雙臂，欲摟抱我們的神聖的愛了。」（《詩集》147）
在這顆衰老、不幸的心靈中，信仰和痛苦使其綻放出最純潔的花朵，這也是神聖的仁慈之心。
米開朗基羅，被他的仇敵們指責為吝嗇鬼的人，一生之中從來沒有停止向那些認識的或不認識的落難人施恩惠。他不僅對父親、家裡的僕人們始終恩愛有加。父親去世後，原來照顧父親的一個叫莫娜·瑪格麗塔的老女傭，便由米開朗基羅收留，而當她去世時，米開朗基羅說，她的死「比他死了親姐妹還要傷心」。他還對一個普通的木匠愛護備至。這個木匠曾在西斯廷教堂製造腳手架，當他女兒出嫁時，米開朗基羅為其女兒置辦了嫁妝……他還常常周濟身邊的窮苦人，特別是一些卑微、害羞的窮苦大眾。有時他會叫上自己的侄子侄女，同他一起施行善舉，培養他們這方面的感情，讓他們代替自己去做這些事，而又不表明自己的身份，因為他不希望受恩惠的人知曉他的仁慈。[1547年8月，在他寫給侄子的信中說：「你寫信說為了上帝的愛，你願意給那個女人四個金幣。我為你的這種做法感到欣慰。」1549年3月29日的信中，這樣說道：「注意，你應該把錢奉獻給那些真正需要幫助的人，不是為了友情，而是為了對上帝的愛……不要提錢是哪來的。」
]「他喜歡行善卻從不炫耀。」源自一種溫柔細膩的情感，使他想到了那些貧苦的女孩子，他想盡一切辦法暗中為她們置辦嫁妝，讓她們能夠婚配或者進入修道院。
「想辦法瞭解那些有女兒欲出嫁，或要把女孩子送到修道院去急需用錢的窮人們，」米開朗基羅寫信給他侄子時這樣說，（他又補充了一句：我指的是那些沒錢又羞於啟齒向別人借錢的人。）「將我寄給你的錢送給他們。記住，一定要悄悄地送過去，但千萬搞清楚情況，不要上當受騙……」（1547年8月寫給里昂那多的信）
之後，他又寫道：
「如果你還認識一些急需用錢的高貴的市民，也要馬上通知我，尤其是家中有女待嫁的。我若能為他做點事情的話，我會很高興的，我的靈魂也會得到救贖的。」（1550年12月20日寫給里昂那多的信）
死亡
「期盼了許久，卻姍姍來遲的死神終於降臨了。」
僧侶般的生活雖然使米開朗基羅有個結實的身體，但沒能使他避免病魔的侵蝕。從1544至1546年，他前後兩次患上惡性瘧疾，而且始終沒有完全治癒，同時，他又患有結石、痛風等各種各樣的病症，他被徹底擊垮了。這一點，我們可以在他晚年時期寫的一首苦中作樂的詩中，感受到他那被種種殘疾折磨的可憐的軀體以及痛苦：
「我孤零零、悲慘地活著，就像包裹在樹皮中的髓質……現在，我的聲音猶如困在骨瘦如柴的軀體中的胡蜂，發出嗡嗡的聲音，我的牙齒像琴鍵一般開始鬆動，我的臉像稻草人一樣乾枯，我的耳朵也總是嗡嗡嗡地響個不停：一隻蜘蛛在一個耳朵中結網，另一隻耳朵裡住著一隻蟋蟀，整夜叫……卡他性炎症讓我常常喘粗氣，徹夜難眠……帶給我榮耀的藝術竟然將我摧殘到如此地步。可憐的老朽，假如死神不能及時救我，那麼我就會被殲滅……疲勞會把我肢解、撕裂、壓碎，等待著我的是死亡……」[出自米開朗基羅《詩集》卷81。
1555年，他在寫給萬塞裡耳的信中提道：「親愛的喬治安，您竟然能夠從我的字跡中，看出我已到了年終歲末了……」
1560年春，萬塞裡耳去探望他，見他已經極其虛弱了。此時的米開朗基羅幾乎無法出門，睡眠也不好，有時整夜都不能入睡。種種跡象表明，他將不久於人世。越衰老，他就變得越多愁善感，不輕易就流淚。
「我去看望了我們這位偉大的米開朗基羅，」萬塞裡耳寫道，「他沒想到我會去看他，所以，見到我時，他激動不已，就像一位找回丟失的兒子的父親一般。他用雙臂圍著我的脖子，一邊吻我，一邊高興得流眼淚。」
然而，他並沒有喪失清明的神志，並且精力旺盛。萬塞裡耳這次去看他時，他拉著萬塞裡耳的手，針對藝術方面的各種問題和他聊了很久，而且還對萬塞裡耳的創作提出了一些建議，並陪他騎馬一起到聖彼得大教堂走了走。
1561年8月，米開朗基羅突然病倒了。當時他光著腳連續畫了三小時的畫，忽然感到一陣疼痛，瞬間倒在地上，開始抽搐。他的僕人安德尼爾最先發現，看他的情況不是很好便喊來其他人。坎瓦尼裡、班迪尼和卡爾卡尼聞訊趕緊跑過來。等他們到來時，他已經甦醒了。可沒過幾天，他又騎上馬出門了，繼續做他那皮亞門的圖稿。
米開朗基羅是個古怪的老人，他不允許別人以任何借口照料他。當他的那些朋友們得知米開朗基羅孤零零地承受著病魔的襲擊，而他的僕人們又總是大大咧咧、漫不經心時，他們感到十分心痛。
他的侄子里昂那多曾經想來羅馬探望他，看看他的身體怎麼樣，竟招到他的一頓臭罵，所以，此刻，侄子即便是為了他叔父的健康問題也不敢貿然趕過來。1563年7月，里昂那多托朋友達尼安·德·沃爾泰爾捎個口信，問問叔父是否同意他去探望，而且，為了不使生性多疑的米開朗基羅懷疑他另有目的，特意補充一句，讓沃爾泰爾告訴米開朗基羅自己的生意挺好，生活很富裕，什麼都不需要了。精明的老人也讓人轉告侄子說，既然生活得這麼好，他感到很欣慰高興，他決定將剩下的錢都分給那些貧窮的人。
過了一個月，里昂那多很不甘心，便又托人向叔父表達他對其身體及僕人們的擔心。這一次，米開朗基羅給他回了封怒氣沖沖的信，從中我們不難看出一位八十八歲高齡的老人，在臨死前六個月，是多麼的充滿活力：
「從你的信上可以確定一點，你一定是聽信了那些無法把我的東西盜走，又不能隨意擺佈我的那些壞蛋的讒言。他們因為不能把我怎麼樣，所以就給你寫了封信，編出了這麼一大堆謊話。這都是渣滓，可你卻這麼愚蠢。對於我的事情，你怎麼會相信他們，好像我是個不懂事的小孩子一樣。去他們的吧。他們這些人到處惹是生非，就知道妒忌別人，他們就是無賴。在信中，你說我的那些僕人們對我漠不關心，可我要告訴你，他們對我真是再忠實不過了，萬事不用我操心，而且非常尊敬我。你還提到你擔心我的東西被人偷竊，告訴你，我家裡的人都值得我信任，我相信他們。我認為你還是關心你自己吧，不必擔心我的事。必要時我會自衛，而且我不是小孩子。你自己多保重吧！」
事實上，關心米開朗基羅遺產的不止里昂那多一個。可以說，整個意大利都是米開朗基羅的繼承人，尤其是托斯卡納公爵和教皇，他們時刻惦記著聖·洛朗和聖彼得的建築圖稿和素描，不讓它們丟失。1563年6月，在萬塞裡耳的建議下，科斯梅公爵命其大使阿韋拉爾多·塞裡斯托裡密奏教皇：因為他的身體在每況愈下，需要密切監視米開朗基羅的僕人們，以及經常到他那去的人。在突然逝世的情況下，應該馬上對他所有財產進行登記入冊，其中包括素描、圖稿、文件、金錢等，並且密切加緊防範，不要讓人乘機渾水摸魚。為此，教皇下達了一些措施。當然，大家都十分小心地進行著，沒有讓米開朗基羅有絲毫覺察。
其實，這些防範措施並不是多餘的。
因為關鍵時刻就要到了。
米開朗基羅生平中的最後一封信，寫於1563年12月28日。這一年，他幾乎沒怎麼自己寫字，大多是口述或簽字。達尼安·德·沃爾泰爾是他的通信員。
他的一生都在工作。1564年2月12日，他站在《哀悼基督》前工作了一整天。14日，他便發燒了。蒂貝裡奧·卡爾卡尼聞訊馬上趕了過來，但當時米開朗基羅並沒在家，而且外面還下著雨。他竟然跑到鄉間去散步了。當他回來時，卡爾卡尼說他這樣做很不應該，外面下著雨怎麼能往外跑？
「沒有辦法啊，」米開朗基羅回答，「我雖然病了，但到哪裡我都得不到休息。」
他的言語開始混亂，目光、臉色的轉變讓卡爾卡尼感到十分不安。「雖然不會馬上怎麼樣，」卡爾卡尼在給里昂那多的信中說，「但我非常擔心馬上就要到來的結局。」
就在這一天，米開朗基羅讓人把達尼安·德·沃爾泰爾請來，待在自己身旁。達尼安還請來了醫生費德裡艾·多納蒂。2月15日，按照米開朗基羅的吩咐，達尼安給里昂那多寫了封信，告訴他可以來看望米開朗基羅，「但路不好走，要多加小心」。
達尼安在信中又補充了幾句：
「剛過八點，我從他身邊離開。當時他神志清醒，情緒穩定，只是身子繼續忍受著麻痺的苦。他渾身都感到不適。下午三四點時，他要求騎馬外出——以往每逢晴天，他都習慣性地這樣做。但今天氣溫很低，而且他還頭疼、兩腿乏力，所以馬沒騎成。從外面回來後，他便坐在爐架旁的安樂椅裡。他喜歡坐在安樂椅裡超過躺在床上。」
守護在他身旁的，是忠實的坎瓦尼裡。
直到逝世的大前天，米開朗基羅才同意躺回到床上。在朋友及僕人們的圍繞下，神志清楚的他用口授的方式，宣佈了他的遺囑。他把「靈魂奉獻給上帝，將自己的軀殼歸還於大地」。他要求「至少死後能夠回到」自己熱愛的佛羅倫薩。之後，他便「從害怕的暴風雨回到甜美的寧靜之中」。（《詩集》152）
二月的某個星期五下午，五點左右。暮色降臨……「這是他生命中的最後一天，也是邁進平和天國的第一天！……」
終於，他安息了。他達到了自己一直嚮往的目標：超越時間。
「幸福的靈魂，對於他，時間將不再流逝！」（《詩集》59）
這便是他那神聖痛苦的一生
就在這個悲劇故事即將結束時，我的心中反而有一種顧慮，這讓我感到很痛苦。我自問，在給那些痛苦的人列舉一些能支撐住他們的痛苦的同伴時，我是否將這些人的痛苦也強加給了那些人；我是不是應該像其他人那樣，只表現出英雄們的英雄主義，而將他們心中的憂傷用薄薄的面紗掩蓋掉？
——然而，不！不行！這是事情！我從未向我的朋友許諾，用謊言騙取幸福；我也沒有立下誓言會不惜一切代價讓他們擁有幸福。我只是許諾，帶給他們真情實況，哪怕需要犧牲幸福也在所不惜；我承諾為我的朋友呈現壯美的真實，永恆的靈魂。它的氣息是淡漠的，但卻清純無比：讓我們柔弱的心沐浴其中吧。
偉大的靈魂就像崇山峻嶺。無論風雨如何吹打它，雲翳將它遮住，但你在那兒要比在其他地方更呼吸順暢、清爽。那裡清新的空氣可以洗滌心靈中的所有污穢；而當雲開霧散時，它便能俯視人類。
米開朗基羅就是這樣一座高大的山峰，高高地矗立在文藝復興時期的意大利。遠遠望去，我們不難望見其巍峨的身影，消失在無垠的天空。
我不認為普通人可以在山峰上生活。但是，他們可以一年一度登到高處頂禮朝拜。在那裡，他們能夠吐故納新，更新血管中的血液；在那裡，他們會感到自己漸漸永恆。之後，當他們重新回到人生的平原上來時，心中已經充滿了面對日常戰鬥的勇氣。
羅曼·羅蘭