“同學們，今天晚上我想在家中舉行一個ＰＡＲＴＹ，，歡迎全體同學參加……不過我有一個小小的要求：每一個參加ＰＡＲＴＹ的同學都要帶上一粒植物的種子。有什麼用途暫時保密……”星期一上生物課的時候，阿汀老師向同學們宣布了一個激動人心的消息。阿汀老師是陽光中學新來的老師，英俊瀟灑。有一次他在學校聯歡會上唱了一首名叫《帶綠色回家》的歌曲，迷得全校小追星族們集體放棄了他們曾崇拜的歌星，改迷阿汀老師。他的提議自然引起了同學們的歡呼，尤其是那些小女生，眼裡放著憧憬和喜悅的光芒。
只有一個人置之度外，他的名字叫楊歌，是個科學天才，他發現，阿汀老師其實是外星人，和宇宙中的一個星球有著神秘聯系。他悲哀地想：恐怕大家都要落入阿汀老師的圈套了。他決定阻撓阿汀老師的計劃，拉住了許多同學，對他們說：“嗨，左大龍，到我家去，我爸又給我買了個變形金剛……喂，白雪，今晚到我家去，我家有好多的卡通書……嘿，左大龍，今晚陪我打電子游戲好不好……”但沒有人聽他的話，大家都想參加阿汀老師的ＰＡＲＴＹ，紛紛湧進花店，將花店裡的鮮花種子搶購一空。
夜悄悄地降臨了，銀河在星空中無聲地流淌，將原野映得落了雪一樣白。阿汀老師的小屋孤零零地矗立在原野上，沐浴著星光。楊歌心情非常矛盾地來到了阿汀老師家中。小屋裡，燭光點點，映著少男少女的活潑、純真的臉，音樂聲讓人陶醉。
“同學們，請大家系好座位上的安全帶，銀河鐵道之夜就要開始了……”阿汀老師說著從懷裡掏出一根銀光閃閃的小金屬棒，輕輕一晃，那玩藝兒迸射出耀眼的白光。大家都感覺到了瞬間的失重，小屋突然變得透明了，飛了起來，孩子們可以清晰地看見屋外的原野、遠方的城市和頭頂的銀河。
“你……你果然是外星人！”楊歌搖搖晃晃地站了起來，指著阿汀老師說道。
“是的，我是來自距離地球一百多年的安卡拉星人，”阿汀老師說話的時候身上迸射出耀眼的銀光，背上“嘩啦啦”地長出一對碩大的、覆蓋著雪白羽毛的巨翅。他繼續說道，“安卡拉星曾經和地球一樣生長著各種植物，欣欣向榮，可是由於人們不注意環境保護，隨意破壞星球環境，如今的安卡拉星寸草不生。為了拯救星球，成千上萬的安卡拉星人被派到地球上來，通過地球人所不知道的辦法偽造假證件、假檔案混入地球人中，采擷地球植物的種子……我請大家來，就是希望各位能在安卡拉星上栽下地球植物的種子……”
楊歌恍然大悟，心中的一塊石頭落了地。
“現在，我們的小屋，不，應該說是銀河列車的一節車廂，已經飛出了地球的大氣層……”同學們低下頭，看見墨色的太空中懸浮著一顆藍色的星球－－－地球。他們還看見許許多多透明的小屋像阿汀老師的小屋一樣，自由地在宇宙間翱翔，追了上來，又飛掠過去。小屋裡，有白人孩子、黑人孩子和棕色人種孩子。每一個小屋裡，都有一位像阿汀老師一樣英俊的小伙子。他們看見了楊歌和他的同學們，紛紛揮手致意。
小屋掠過了月球、木星、小行星帶……冥王星，飛出了太陽系。所有的小屋都變成了透明的五角星，在太空中排成了一字長蛇，飛向一條綠色的、透明的，以拋物線形狀伸向銀河深處的管道－－－銀河鐵道，以超光速向前挺進……
經過兩個多小時的旅行，地球孩子們到達了安卡拉星，將地球植物的種子埋進了安卡拉行星的胸膛。安卡拉星人又利用他們的高科技使安卡拉星重新變成了一個綠色覆蓋的星球。地球孩子與安卡拉星人手拉著手盡情地唱啊、跳啊……直到他們累了，無所顧忌地躺在草地上，昏昏沉沉地睡去。第二天早晨，他們醒來時，發現自己躺在自己家裡的床上，陽光大把大把地潑灑進來，奇妙的銀河鐵道之夜像一場美麗的夢，宛若隔世。