華盛頓的演講得到了參眾兩院的普遍歡迎，議員們完全同意總統的觀點。會議中的財政問題引起了議員們的激烈爭論，根據總統的要求，財政部長向大會進行了匯報，議員們對這個報告不置可否，只是共同指責了軍隊的問題。議員們把軍事領域的花費和軍隊的作為相比較後，得出常了備軍是國家負擔的結論。華盛頓只是授權財政部籌措貸款，卻並沒有到財政部聽取關於貸款使用的細緻匯報。弗吉尼亞州代表率先對財政部進行了反對，他們希望對此事進行細緻的調查。漢密爾頓也因此向國會遞交了所有的資料，但直到國會閉幕，很多人都依然抓著財政部的問題不放。華盛頓自己從來都不會參與黨派之爭，這便使他掌握了一些主動權。1793年2月22日是華盛頓的生日，國會決定休會半天，以方便議員們向總統表達表達友情。這項建議遭到了很多人的反對，他們感覺這是在樹立個人形象，照此下去會有損自由。華盛頓十分在意民眾對他的評價，所以也不同意大家為他過生日。早在第一次就職總統的時候，傑斐遜就對他進行過指責，說他在有意效仿西歐宮廷的禮儀。
總統第二次就職儀式就快舉行了，華盛頓因此召開了有關部門的會議，徵求大家對就職儀式的意見。各部部長就總統就職一事進行了討論，最終確定3月4日，在參議院會議廳舉行總統就職儀式，同時還簡化了很多程序。
這時候的法國白色恐怖仍在進行著，大家在無休止的打殺中度過了整整一周的時間。大屠殺先從二百多名牧師身上下了手，接著便是犯罪嫌疑人。因為這些牧師回絕宣讀政府頒布的誓詞，所以便遭到了殺害。這種事情的出現讓傑斐遜感到十分悲痛，同時，傑斐遜還十分擔心此事會讓法國的雅各賓派失去名譽。在他看來，雅各賓派是共和憲政的支持者，但隨後他又發現，假如按照當前的局勢繼續下去，雅各賓派可能會對君主專制進行復辟。從實事上看，雅各賓派在沒有進行任何審訊程序的情形下，斬殺了很多所謂「罪孽深重」的人。傑斐遜因為這些人的被殺而深感悲痛，進行革命需要依靠人民的力量，但千萬不能過於盲目。為了自由，很多人都獻出了寶貴的生命，這場革命必將決定大家的命運。但是傑斐遜自己不願意再看到流血死亡的事件出現。
對於這個問題，華盛頓的觀點和傑斐遜的不是很一致。他冷靜地對法國革命的發展動態進行著觀察。10月23日，莫裡斯給華盛頓寫了一封信，向他敘述了法王路易十六被斬首的經過，意在引起華盛頓的憐憫和同情。莫裡斯非常希望法國人民能夠得到幸福，但是在當前的恐怖環境裡，恐怕每個人都無法安睡。因此，他希望能夠有一個英明的政府，把所有奸佞之徒都統統清除乾淨。
法國的大革命震盪了整個世界，數月後，有消息傳來說法國準備和大不列顛進行戰爭，這讓部分美國人高興不已。美國人正在籌劃著該為他們的盟友們提供什麼樣的協助，很多人的情緒都很激動，主張美國立刻參戰。令人欣慰的是，這種衝動只不過是一時的現象，華盛頓有效地將這種危險傾向遏制住了。華盛頓在弗農山莊的時候聽說了這一消息，因此，他馬上便寫信給傑斐遜，讓他採取嚴厲的措施來禁止美國民眾參與到這件事情中去。同時，華盛頓還讓國會對外宣佈美國在這件事情裡嚴守中立。1794年4月19日，才剛趕回到費城的華盛頓立即主持召開了內閣會議，探討在當前情形下美國應該怎麼辦的問題。會上決定，嚴禁美國公民在公海上從事對任何一方的敵對行動；警告美國公民，不得向戰爭雙方違法販運任何軍事物資；不得採取有損與戰爭國友好相處的行為。直到現在，還沒有人對華盛頓的這一決定進行反對。假如參戰的話，由於國力不足，美國必將會受到損失。
雖然這樣，這一決定和一些民眾的心情還是不合的，出於對華盛頓的欽佩，他們普遍保持了克制的態度。華盛頓也意識到了自己與政府、民眾的意願不合，但是他卻依然嚴守著中立的政策。因此，他決定不管個人的威望損失有多大，都堅持維護中立的政策。法蘭西共和國不久便任命埃德蒙·夏爾·熱內為駐美公使，全力爭取到了美國政府的支持。熱內為人熱情奔放，受到過良好的教育。君主制被推翻後，他加入了人民黨，變成了一位十分狂熱的革命者，是雅各賓俱樂部內的主要活躍分子。莫裡斯寫信對傑斐遜說，熱內此次前往美國的重要任務便是在美國招募300名志願擔任軍職的將領。法國人認為，有了他們的支持，本國對大不列顛的戰爭便可以獲得成功。熱內的行動很快便驗證了這一情報是準確的，熱內於1794年4月8日在南卡羅萊納的查爾斯頓上了岸，很快就乘船去了百英里外的港市。熱內的用意已經十分明顯。熱內沒有考慮大使應當遵循的禮儀程序，便不顧自己的身份直接去鼓動美國民眾進行參戰。來到了港市後，他鼓動美國海軍從該港出發，去對大不列顛和西印度群島之間的貿易來往進行破壞。
直到4月的下旬，熱內才動身趕往了費城。報紙跟蹤報道了他在美國的活動和民眾對他表示歡迎的情況，並且還發表了熱內的演講。英法戰爭在美國的影響很大，美利堅合眾國的自由民主精神被煥發了起來。從波士頓到查爾斯頓，所有報紙的每個字裡都體現著自由的精神。傑斐遜對熱內的評價也非常高，認為他的來到會極大地促進兩國關係的發展。漢密爾頓對此抱有不同的意見，他感覺熱內不像是一位大使，倒更像是法國政府的一名說客。漢密爾頓坦率地告誡大家，他感覺熱內此次的目的很明確，那就是把美國也拉入到英法戰爭中去。熱內於5月16日抵達了費城，以前他在查爾斯頓的行為引起了大不列顛駐美大使的強烈不滿，大不列顛大使哈蒙德向美國政府提出了強烈的抗議，但這卻分毫不影響民眾對熱內的喜愛。市民們由衷地對熱內的到來表示歡迎，他們自願組成了龐大的歡迎隊伍，聚集在格雷斯渡口等候熱內。可令人感到意外的是，熱內這次並沒有大張旗鼓地露面，而是乘著小艇悄悄地抵達了費城。
7月初，華盛頓莊園的管理人去世了，華盛也因此返回了弗農山莊。在弗農山莊逗留的期間，法國戰船俘獲了大不列顛商船「小薩拉」號，然後又將此船拖到了費城。他們不但處理了英國人，還對該船進行了改造，重新配置了120名船員。這種行為嚴重違反了美國政府的法令，國務院馬上就此事對熱內提出了抗議，熱內卻並沒有理睬。該船改裝後著手遠航，賓州州長米夫林規勸熱內暫且中止這一安排，所有事情等到華盛頓回來後再說，不然的話，他將用武力阻止該船離港。熱內十分懊惱，他感覺美國人不夠朋友。他對米夫林表示，華盛頓總統不經過國會的批准便無權下達命令。
不只這樣，熱內還聲稱要把此事交給美國全民進行公決，假如賓州膽敢以武力阻止該船出港的話，他將同時動用武力。米夫林感到十分氣憤，便馬上把這一事件告訴了內閣。事件到了非要傑斐遜出面進行解決的地步了，他重申了華盛頓做出的嚴守中立的指示，要求熱內馬上放棄該項行動。熱內感到十分不滿，於是便發表了一氣的抗議聲明。熱內發完火後，傑斐遜便向他進行解釋，他給熱內講了政府是立法、行政、司法三權分立的職能機構，各個部門全部都有對應的權力來做決定，而不會受到其他部門的制約。這是美國的特殊政治制度，同時，傑斐遜還告訴熱內，即便是召開國會，國會也不會因此對應由華盛頓總統作決定的事情進行干預。熱內驚異地問國會還是不是最高權力機關，傑斐遜的回答是否定的。傑斐遜最後告訴勒熱內，假如打算令此事快速解決的話，唯一的辦法就是取決於總統的態度。
直到此時，熱內才發現原來自己對於美國憲法一竅不通。傑斐遜此時再次建議「小薩拉」應該扣押在港，等候總統回來。熱內告訴傑斐遜說，該船現在費城南部裝貨，他無法做出擔保，但從他的態度上看，傑斐遜認為該船在一時間還不會出海。這樣，傑斐遜便返回了政府大樓，同時他命令米夫林對那艘船進行嚴格的看管，一旦發現什麼動靜，要立即向他匯報。諾克斯信和漢密爾頓信不過熱內，他們提議在羅德島上派一個炮兵連，假如該船逃走的話，那就立即將其炸沉。但是傑斐遜卻並沒有同意此項提議。
7月11日，華盛頓返回了費城。傑斐遜馬上向他報告了「小薩拉」事件的經過，華盛頓聽說後感到十分生氣，他當即表明不能讓法國公使這樣蔑視美國的法律。同時，華盛頓還聲明這是一件十分嚴重的政治事件，假如處理不當的話，很有可能會在國際上造成十分不好的影響。不過還好有已經得到了法國公使的保證，如果沒有總統的決定，此船就絕不會離開美國。次日，華盛頓主持召開了內閣會議，會議決定對停留在美國海港內的法國船進行扣押。國務院把決定通知給了熱內，不曾想熱內竟然公然對美國政府的決定表示對抗，私自起錨開航了。華盛頓看到總統的權威已經受到了挑戰，並且很多群眾還站在了敵軍的那一邊，感到十分惱火，他的精神也受到了很大的打擊。