在許多重大項目上，如《玩具總動員1》和蘋果專賣店，喬布斯都會在其接近尾聲的時候叫停，要求作出重大修改。iPhone的設計過程也逃不開這個命運。其最初設計是將玻璃屏幕嵌入鋁合金外殼。一個週一早晨，喬布斯走到艾弗跟前說：「我昨晚一夜沒睡，因為我意識到我就是不喜歡這個設計。」這是自第一台麥金塔問世後喬布斯最重要的產品，可他就是看不順眼。艾弗瞬間意識到，喬布斯說的沒錯，於是很沮喪：「我記得自己當時感到非常繼尬，因為居然要等到他來發現這個問題。」
問題在於，iPhone的重點是屏幕顯示，而他們當時的設計是金屬外殼和屏幕並重。整個設備感覺太男性化，太注重效能，是一款任務驅動型產品。「夥計們，在過去9個月你們為了這個設計拚死拚活，恨不得殺了自己，但是我們要改掉它。」喬布斯告訴艾弗的團隊，「我們要沒日沒夜沒有週末地工作，如果你們願意，我現在就給你們發幾把槍，把我們全幹掉。」然而團隊成員並沒有遲疑，同意修改。「這是我在蘋果最值得驕傲的時刻之一。」喬布斯回憶說。
新的設計出來了，手機的正面完全是金剛玻璃，一直延伸到邊緣，與薄薄的不銹鋼斜邊相連接。手機的每個零件似乎都是為了屏幕而服務。新設計的外觀簡樸而親切，讓人忍不住想要撫摸。而這也意味著，必須重新設計製作手機內部的電路板、天線和處理器，但是喬布斯認可了這種改動。「其他公司做了這麼長時間可能都已經發貨了，」法德爾說，「但是我們按下了復位鍵，重新來過。」
這款手機完全密封，這不僅體現了喬布斯的完美主義，也展現了他的控制欲。手機無法打開，也不可能更換電池。就像1984年最早的麥金塔一樣，喬布斯不想讓人在裡面亂動。事實上，2011年，發現第三方修理店能夠打開iPhone4後，蘋果公司放棄了之前使用的小螺絲，而改用一種五角形防撬螺絲，用市售的螺絲刀無法打開。由於無需更換電池，iPhone可以更薄。對喬布斯來說，總是越薄越好。「他始終以纖薄為美，」蒂姆·庫克說道，「從我們所有的產品上就能看出。我們有最薄的筆記本電腦，最薄的智能手機，我們的iPad也很薄，而且以後會更薄。」