清晨，一縷陽光穿過烏雲，投射在海面上，三隻殘破的戰船孤零零的在海上漂蕩，而他們的主人責一個個面面相覷，昨晚的結果已經同耿精忠弄得所有人都知道了，失望之餘這些人不得不考慮下一步該怎麼辦。
去朝鮮，或者是中原，不可能，這些人手上血案纍纍落到我的手裡一個個定然會不得好死，去中原，誰會相信被傳的沸沸揚揚的兩隻神秘的箱子裡居然是組織臟器和屍體，他們仍然要遭到各方的追殺，那麼只有繼續前進去日本了。在那裡沒有人認識自己，也沒有人知道這些事，或許會安全的，可是這些海盜並不明白死神已經向他們伸出了恐怖的黑手。
寬永2年，作為為日本史上第七位女天皇，剛剛7歲的興子登上了日本天皇的寶座還不到一年，他的父親後水尾天皇由於和幕府關係不和，更因為1629年將軍德川家光竟然派他的乳母春日局前往面見天皇，由於春日局無官無位卻前往面見天皇，被天皇認為是奇恥大辱，覺得幕府沒有把他的權威放在眼裡。於是在同一年，憤怒的天皇無預警讓位給才只有七歲不到的皇女興子內親王，成為明正天皇。後水尾天皇退位後，仍以太上天皇身份攝政，並且沉迷於和歌與佛道。
不管日本國內的政治如何更迭，但是一場瘟疫毫無先兆的降臨在這個小島國家。作為當時將軍德川家光的外甥女，憑著和德川家有血緣關係，所以在明正天皇與幕府保持良好的關係。但是這並不能挽救這場迅速而突然的瘟疫，一直以來憑藉著自己是島國人員流動不大，加上封閉日本躲過了很多次瘟疫的肆虐和橫行，但是這一次彷彿是天降災星一樣，瘟疫來的迅猛而突然。
瘟疫首先在長崎爆發，隨後向整個日本國擴散，患病者出現發燒、淋巴結腫大、咳嗽、胸痛、就是唾液中也含有血液，並且藥石無效，這種瘟疫已經超出了日本人的認識範疇，在整個日本造成了極大的恐慌。
更有甚者日本社會開始動盪，有人將矛頭直指幕府，當然也有人開始抱著及時行樂的態度去對待生活，面對無法預見和不可避免的瘟疫，很多人破罐子破摔，開始了放蕩的生活，瘟疫對整個日本社會已經成了一次極大的挑戰。
在這種時候德川家光不知道從哪裡聽說，為了避免瘟疫的傳播他竟然派兵將患了瘟疫的村子整個焚燬，不管人畜，雖然這起到了一定的作用，可是也把病毒和病菌帶到了軍隊，一時之間日本軍隊處於恐慌和癱瘓狀態。
日本的變故使得一開始對我禁止和日本通商的決定進行反對的朝鮮乃至中原的商人態度大為轉變，很多人都暗自捏了一把汗，對我的這種先見之明佩服不已。現在已經用不到我去約束這些商人了，和自己的命比起來，錢也就不重要了。
與此同時回到朝鮮的我開始佈置在整個行政區域內大面積接種牛痘，不管是任何人必須無條件的強制性的接種牛痘。牛痘技術經過一年來多的臨床試驗已經證明是一種簡單而又十分有效的辦法，並且這種技術已經十分成熟了。
從前天花只在「舊世界」(亞洲、歐洲和非洲)流行，在17、18世紀，它是西方最嚴重的傳染病，但是在歷史上的影響卻比不上鼠疫，這可能是因為其受害者以兒童為主(約1/10的兒童因天花夭折)，活下來的成年人大多已有了免疫力，這樣它所造成的死亡率遠沒有鼠疫高。
但是當歐洲殖民者在15世紀末登上新大陸的時候，情況就不同了。歐洲殖民者給新大陸原住民帶去了多種從未遇到過、因而不具有任何免疫力的傳染病，其中最致命的一種就是天花。為什麼科爾特斯率領300名西班牙殖民者能夠征服有2500萬人口的阿茲台克帝國(現墨西哥)？靠的秘密武器就是天花：阿茲台克人俘虜的一名西班牙士兵不幸染上了天花。10年內，阿茲台克人口減少到650萬人，生存者也喪失了鬥志，一個強大的帝國就此消亡。另一個強大的帝國印加帝國(現秘魯及周邊國家)也因為天花流行而被皮薩羅帶著180名西班牙殖民者輕而易舉地征服。北美的殖民者則有意將天花傳給印第安人，給他們送去天花患者用過的毯子，在天花的肆虐下，幾個原先有數百萬人口的主要印第安部落減少到只剩數千人或完全滅絕。在與殖民者接觸之前，美洲原住民大約有兩三千萬人口，而到16世紀末，只剩下100萬人。
有著這樣慘痛的經驗教訓，使得我痛下決心徹底的貫徹實施牛痘的強制免疫，以免重蹈印加帝國的覆轍，同時開始加速對鼠疫疫苗的研究。
平壤大學的實驗室裡，只有我一個人在忙活，我知道這是一項極其高危的工作，稍一不慎我自己也會刮掉，人們常說常在河邊走哪能不濕鞋，何況這時的防護措施如此簡陋。治療鼠疫最好的辦法就是抗生素，鏈黴素、慶大黴素、四環素、磺胺嘧啶等都對其有療效只要及時治療可將死亡率降到5％以下。然而這個時代並沒有抗生素，以我所擁有的技術條件來說，也生產不出來，同時我也不會生產抗生素，就算是生產出來哪所耗費的成本和時間絕對不是小數目。生產出來又如何，數量定然極少還是有人會死，我又不能面對所與人，所以疫苗成了我要開發以及研究的重中之重。
雖然免疫學最早可以追溯到公元前430年古代雅典的一場傳染疾病。古代希臘歷史學家多笛特斯(Thucydides)記載，人們在疾病復原以後，可以免於第二次疾病帶來的侵害。許多古時候社會均循這個現象，但直到十九、二十世紀前，仍未發展成一套科學理論。免疫學的真正發展是在二十世紀中葉以後，短短的五十多年裡有了迅猛的發展，但是即使是這樣免疫學還有很多沒有攻克的難題，尤其是研究免疫學分子及細胞等成份之功能及相互作用，為當代免疫學的主流。
所以我在這個時代所帶來的免疫學知識絕對是超前的，沒有任何人能夠取代，而他所給人類帶來的益處，將由朝鮮以及遼東的百姓率先受惠。