皇宮內一片混亂，大量錦衣衛，宦官，宮女見到朱祁鈺率軍殺了進來，紛紛跪在了路邊。他們都只能算是奴才走狗，朱祁鎮做了皇帝，他們自然要聽從朱祁鎮的指揮，而現在朱祁鈺殺了回來，他們也就自然倒向了朱祁鈺一邊，在這場風波中，他們是沒有自己立場的，誰是皇帝，他們就為誰服務！
「陛下，陛下！」
朱祁鈺停了下來，旁邊的金英見到跑來的那名宦官，立即在朱祁鈺耳邊說道：「這是孫太后身邊的近臣！」
朱祁鈺皺了下眉毛，並沒有說什麼。
「陛下，太后請陛下過去！」
「太后？不去！」朱祁鈺正在火頭上，他早就看這個孫太后不順延了，朱祁鈺走了兩步，又停了下來，對金英說道，「派一隊侍衛去守住太后寢宮，沒有朕的手諭，誰也不得進出！」
金英點了點頭，立即叫來一名錦衣衛統領，將朱祁鈺的命令交代了下去。
等到侍衛押著那名宦官走後，朱祁鈺立即帶著其他人直接朝勤政殿奔去。那裡是皇帝的御書房，朱祁鎮要躲在皇宮內的話，最有可能在那裡。等朱祁鈺帶人趕到的時候，出了勤政殿外的兩名宦官之外，裡面空無一人！
「給朕搜，就算是把換工翻過來，都要找到上皇！」
結果，讓朱祁鈺很是失望，侍衛搜遍了整個皇宮，都沒有能夠找到朱祁鎮，也沒有找到徐有貞，這兩人彷彿人間政法了一樣！接著，朱祁鈺給羅國棟與陳懋下了同樣的命令，讓他們搜索正個京城，尋找朱祁鎮與徐有貞兩人。整個大搜索持續到第二天清晨，仍然沒有這兩人的任何消息！
「陛下，徐有貞肯定挾持上皇逃出了京城！」于謙此時雖然神色平靜，不過在經歷了昨日的巨變之後，他的心情產生了很大的變化。「昨日京城戰亂，局勢相當混亂，如果徐有貞要安心逃跑的話，必然有很多機會！」
朱祁鈺閉口不言，在經歷了這麼多的事情之後，一下就能看出，他的承受能力遠不及于謙。
「陛下，臣立即率兵去追！」
「追？」朱祁鈺身體微微顫抖了一下，「陳懋，讓你的騎兵立即出城，搜索京城周圍百里之內，任何可疑人等，都不要放過！」
「臣領旨！」
等陳懋出去之後，朱祁鈺才長出了口氣，徐有貞肯定是趁亂帶上朱祁鎮趁亂逃出了京城。而京城周圍道路四通八達，而當時朱祁鈺手下的軍隊都集中在了京城周圍，外圍的封鎖並不嚴密。如果徐有貞存心要逃的話，恐怕現在已經在數百里之外了，有那麼容易追上嗎？
「陛下！」這時候，于謙又走了過來，「賊首徐有貞雖然逃掉了，不過，石亨，曹吉祥兩人卻已經被拿下，陛下準備如何處置這兩人？」
朱祁鈺一愣，手剛舉起，又放了下來。「曹吉祥不過就是個奴才，殺了他並無什麼可惜的。石亨確實是一員大將，這次讓朕吃了不少的苦頭，陳懋都差點栽在他的手裡，殺了他，是不是太可惜了？」
于謙眉毛一跳，說道：「陛下，策劃叛亂的是徐有貞，石亨，張輒，曹吉祥四人，他們皆為賊首，而現在眾將軍親人都已被害，如不殺石亨，恐怕難以讓將士們平靜下來！」
朱祁鈺慢慢的點了點頭。「那你說，應該怎麼處置這兩人？」
「按大明律令，作亂反上者，皆應凌遲，且操家滅族！」
朱祁鈺咬了咬牙，然後微微的點了下頭。「于謙，這些事情你去安排，不過，朕想見見石亨！」
于謙默默的點了下頭，就讓人去把石亨帶來了。他也很清楚朱祁鈺是個愛才的皇帝，石亨在戰場上的表現可以說是非常好，如不是實力不如朱祁鈺，加上徐有貞的胡亂指揮，石亨並不會敗得這麼快，甚至有可能讓朱祁鈺蒙受更大的損失！這石亨是個人才，就算他的叛亂賊首，朱祁鈺仍然不想殺了他，可局勢逼得朱祁鈺不得不殺此人！
很快，石亨就被帶了進來。此時，他已經沒有了當初在通州時的囂張氣焰了。在最後關頭，徐有貞不但奪了他手裡的軍權，而且還將石亨關進了召獄。結果，徐有貞逃了，而石亨卻根本逃不掉，當陳懋率軍趕到召獄時，如非朱祁鈺早有命令，石亨也身首異處了！而給石亨最大打擊的還是朱祁鈺昨日在城外說的那番話。如果徐有貞是蒙古奸細的話，那他這次叛亂就是給徐有貞幫了忙，而他自己不僅僅背負上了亂臣賊子的罵命，而且還丟了性命，那不太冤了嗎？
「石亨，你還有何話可說？」
石亨看了朱祁鈺一眼，立即就避開了朱祁鈺的目光。
「也許，你早就想到了會有今日，不過，讓你沒有想到的是，你自認為這是匡復大明的機會，卻最終被小人所利用吧？」朱祁鈺冷笑了一下，「石亨，朕承認你是一名非常優秀的將領，如果我們實力均衡的話，朕還不一定能夠在戰場上打敗你。不過，你卻只是個軍人而已，在政治上，你太幼稚了，你認為徐有貞是你能夠對付的嗎？不過，你現在後悔已經太晚了，朕告訴你吧，徐有貞已經逃了，他將你關進召獄，就是要你留下來頂罪，讓你背上萬世罵名，讓今後所有的大明子民都只到有你石亨這個賣國賊！」
「陛下！」石亨腳一軟，跪了下來，「罪臣該死，請陛下賞罪臣一死！」
「對，你確實該死，而且就算朕看在你是個人才，想饒你，也不可能，你若不死，朕怎麼去向那些失去了親人的將領交代？」朱祁鈺沒有去扶石亨，「不過，朕要你在死前明白，你是被人利用了，你所做的，都只是小人手上的利器而已，而你自己，不但什麼都得不到，還將失去一切！」
「陛下……」石亨痛哭了起來，想到自己被人所利用，做了這麼多的傻事，他的心情也沮喪到了極點。
「放心，朕已經下了詔書，只殺賊首，其餘人等皆不治罪。朕不是劊子手，更不是徐有貞那種喪心病狂的人，朕不會為難你的家人，你就安心上路吧！」
「謝陛下，謝陛下！」
朱祁鈺轉過了身去，並沒有去看石亨。幾名侍衛把石亨拖了出去，此時，一旁的于謙也鬆了口氣。石亨是必死的，不然陳懋，羅國棟，衛平這些將領都會不滿，不管從何種角度來講，石亨都得死！
三日之後，石亨與曹吉祥就被押到了刑場，當著數十萬官兵，百姓的面，兩人身受上千刀，才最終被處死！凌遲是最為殘酷的刑罰，一般也只用在叛亂賊首的人身上，行刑者用鋒利的刀片將犯人身上的肉一塊塊的割下來，然後止住血，再繼續割……直到犯人身上沒有一塊完膚之後，才最終處死犯人！
處決了石亨與曹吉祥之後，朱祁鈺還沒有收到任何關於徐有貞與朱祁鎮的消息，陳懋部下騎兵已經將搜索範圍擴大到了北直隸之外的地區，卻仍不見兩人蹤影！最後，朱祁鈺不得不下召，讓全國各地的官府衙門負責尋找兩人，並且帖出皇榜，任何提供有關此兩人消息者，都將得到重賞！
當然，朱祁鈺的注意力不可能一直停在徐有貞與朱祁鎮的身上。在京城局勢穩定之後，朱祁鈺必須要為更長遠的打算考慮了！
這次的叛亂絕非偶然，名義上，徐有貞，石亨等人打著上皇復位的旗號作亂，實際上，叛亂根源是在朱祁鈺之前推廣的新政之上！如果沒有朱祁鈺的新政，王直等大臣根本就不會默認叛亂，徐有貞更沒有機會回到京城，再做京官！也正是王直等人的默許，讓徐有貞抓住了叛亂的機會！
可以說，這次叛亂給朱祁鈺的衝擊很大，讓他有一種再世為人的感覺。叛亂平定之後，朱祁鈺也不得不考慮今後的安排了！新政是不可能取消的，大明要想強大，要想成為世界頭號強國，就必須要實施新政，廢除舊制！如果不改變朝政體制的話，那麼這將是眾多叛亂的開始，今後仍然會有更多的叛亂發生！要想推廣新政，又要想保持國內局勢穩定的話，唯一的辦法就是改組朝政，來一次政治大洗牌，用快刀斬亂麻的辦法，徹底廢除舊制，施行新的政治制度，為將來全面推廣新政打下基礎！
當然，要確定新的政治體制，光靠朱祁鈺的想法，乃至光靠他的一個人的努力是絕對不夠的。這次叛亂也讓朱祁鈺意識到，他雖然是皇帝，可治理國家並不是一個人，乃至幾個人的事情。要想穩固手裡的權力，他還要戰勝更多的困難，他需要更多的幫助！這些，都需要他去做，而不是想！
朱祁鈺絕不是那種只想不做的人，當他確定了想法之後，立即就展開了行動。叛亂之後，原朝中大臣八成以上不是被砍了腦袋，就是被削去了一切職務與爵位，可以說，朝中百廢待興，這也正好給了朱祁鈺一個改組朝政的機會。朝廷混亂的狀況，也給了朱祁鈺完成這次政治洗牌的機會！
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靖康雪恥錄